He aquí los 30 máximos goleadores de la liga EUSKALHERRIA 1999-2000:

 1. Pastor, Oscar (Castellae) 51 Goles
 2. Iordanov, Kiril (Castellae) 49 Goles
 3. Bilbao, Iñaki (D.Naútica P.) 39 Goles
 4. Martinez, L.M. (D.Naútica P.) 34 Goles
 5. Moyano, Diego (Ademar) 33 Goles
 6. Bascones, Nacho (UPV Askartza) 32 Goles
 7. Sierra, Mikel (Santurtzi) 30 Goles
 8. Velez de M., Jon (Ademar) 28 Goles
 9. Cañoto, Jorge (Santurtzi) 26 Goles
9. Yañez, Carlos (C.D.Bilbao) 26 Goles
11. Pereda, Alex (C.N.Fadura) 25 Goles
12. Garcia, Dario (Larraina) 24 Goles
12. Lopez, David (C.N.Fadura) 24 Goles
14. Ezkerra, Jon (D.Naútica P.)  22 Goles
14. Gomez, Arkaitz (C.N.Fadura) 22 Goles
14. Vegas, Josué (C.D.Bilbao)  22 Goles
17. Garcia, Andoni (Santurtzi)  21 Goles
18. Pereda, Marcos (C.N.Fadura) 20 Goles
19. Aparicio, Ruben (D.Naútica P.)  19 Goles
20. Gomez, Argider (D.Naútica P.)  18 Goles
20. Lopez, Jon

(UPV Askartza)

 18 Goles

22. Ampudia, Juanjo

(UPV Askartza)

  16 Goles

22. Pentchev, Jani

(Castellae)

 16 Goles

24. Gomez, Adonai

(D.Naútica P.)

 15 Goles

24. Moja, Ignacio

(Ademar)

 15 Goles

26. Belloso, Cesar

(C.N.Fadura) 

 14 Goles

26. Baquedano, Juan

(Larraina)

 14 Goles

26. Esteban, Jon

(Larraina)

 14 Goles

29. Serna, Iñaki

(Santurtzi)

 13 Goles

30. Larrauri, Mikel

(D.Naútica P.)

 12 Goles